โรงเรียนฟากท่าวิทยา ตั้งอยู่บนที่เนินสูงทางทิศตะวันออกของบ้านฟากท่า หมู่ที่ 1 ตำบลฟากท่า สภาพพื้นที่ลาดเอียง จากทิศตะวันออก ซึ่งเป็นเชิงเขามาทางทิศใต้และทางทิศตะวันตก มีเนื้อที่ทั้งหมด 63 ไร่ 1 งาน 98 ตารางวา ตั้งอยู่เลขที่ 41 หมู่ที่ 1 ตำบลฟากท่า อำเภอฟากท่า จังหวัดอุตรดิตถ์ ห่างจากที่ว่าการอำเภอฟากท่า ไปทางทิศเหนือประมาณ 1 กิโลเมตร ห่างจากตัวจังหวัดอุตรดิตถ์ 125 กิโลเมตร มีอาณาเขตติดต่อ ดังนี้
- ทิศเหนือ ติดต่อกับโรงเรียนวัดโพธิ์ชัย
- ทิศใต้ ติดต่อกับถนนยุทธศาสตร์เก่า และบ้านฟากท่า
- ทิศตะวันออก ติดต่อกับภูเขา และลำห้วยสับฟาก
- ทิศตะวันตก ติดต่อกับถนนสายฟากท่า - อุตรดิตถ์ และบ้านฟากท่า